薬師寺と関係があるのかと問う人がよくいますが、宗派も違うので特に密接な関係はないようです。ちなみに｢新薬師寺｣は華厳宗、｢薬師寺｣は法相宗になります。
　4月8日はお釈迦様の誕生日で各お寺が行事を行いますが、ここ新薬師寺でも本尊・お薬師さまのご縁日のこの日に、修二会の法要が行われます。修二会は東大寺の「お水取り」が有名ですが、本来は各お寺で行われていた行事です。ただ、衰退し数少なくなってしまいました。 本堂横にある修二会で使うこの「おたいまつ」は同じ華厳宗である東大寺から寄進されたものです。

東大寺二月堂で行われる修二絵（お水取り）と比べるとかなり間近でゆっくり移動するので迫力があります。「おたいまつ」が通過するときに炎が目の前で吹き上がり歓声が湧き上がります。この重そうな「おたいまつ」は一人で支えているのですが、東大寺の修二絵のように派手に振って火の粉を落とすというようなことは、ほとんどありませんでした。それでも11回中2回くらいはやっていただけました。燃え残った炭は持って帰ると無病息災であるということで、この行事のあとすぐに観光客が取り合ってました。